По мнению следствия, непосредственной причиной аварии стала нештатная (с поворотом на 180 градусов относительно нормальной) установка датчика угловых скоростей в канале рыскания системы управления, что исказило ее работу.
По итогам длившегося почти два года расследования обвинения в нарушении правил безопасности при ведении работ предъявлены трем рядовым сотрудникам Центра имени Хруничева – электромонтажнику специзделий, мастеру и контролеру Диане Гудковой. Кроме того, обвинение в халатности предъявлено начальнику 1653-го военного представительства минобороны Марату Насибулину.