Запуск состоялся в четверг, 20 апреля, в 13.13 астанинского времени со стартовой площадки №1 ("Гагаринский старт") космодрома "Байконур". Стыковка транспортного пилотируемого корабля "Союз МС-04" с Международной космической станцией должна произойти в этот же день в 19.22 по времени Астаны.
В составе международного экипажа — командир Федор Юрчихин (Роскосмос, Россия) и бортинженер Джек Фишер (НАСА, США). Пуск ракеты-носителя "Союз-ФГ" прошел в штатном режиме. Планируемая продолжительность данной экспедиции составит 136 суток.