Он отметил, что до настоящего времени из-за принципиальных разногласий сторон не решен вопрос функционирования в городе Байконыре подразделений государственных органов Республики Казахстан. «Несмотря на то, что указанному вопросу в течение года уделялось внимание на двусторонних встречах самого различного уровня, согласованной позиции по нему стороны не выработали. Считаем необходимым сторонам в кратчайшие сроки завершить согласование данного вопроса», — сказал Мусабаев в среду, выступая на 12-ом заседании подкомиссии по комплексу «Байконур».
Глава «Казкосмоса» также подчеркнул, что сторонам необходимо ускорить выработку решений по таким важным вопросам, как организация обучения казахстанских граждан в городе Байконыр в соответствии с требованиями государственных образовательных стандартов РК, гарантии пенсионных прав казахстанских граждан — жителей города Байконыр в случае их переезда в другие регионы Казахстана или в случае завершения срока аренды комплекса «Байконур».
По словам Мусабаева, на сегодняшний день подписано межправительственное соглашение о порядке посещения комплекса «Байконур», завершается подготовка к подписанию межправительственного соглашения о порядке медицинского обслуживания персонала космодрома, жителей города Байконыр, посёлков Торетам и Акай в условиях аренды Россией «Байконура».
Город Байконыр в Кызылординской области, в котором проживает около 60 тысяч жителей, с 1991 года, после распада СССР, находится в российской юрисдикции вместе с арендуемым российской стороной космодромом «Байконур».