Лицензию на ведение образовательной деятельности в Атырауской области в 2001 году имеют филиалы Центрально-Азиатского университета (ЦАУ), Казахского института экономики и права (КИЭиП), российско-казахстанского современного гуманитарного университета (РКСГУ), института менеджмента и маркетинга (ИМиМ), Атырауского инженерно-гуманитарного института.
Между тем закрылись такие известные ВУЗы как "Кайнар", Евразийский гуманитарный институт и другие.
Результатами акции "За честное образование", проведенной министерством образования РК, министерством юстиции РК, генеральной прокуратурой РК стало то, что 14 частных ВУЗов полностью прекратили свою деятельность, в том числе ликвидированы пять институтов по решению генеральной прокуратуры. Причиной закрытия стало то, что в этих ВУЗах не был укомплектован штат преподавателей, слабой была материально-техническая база.