По словам Н. Назарбаева, министерству должны быть переданы контрольные функции министерств энергетики и сельского хозяйства по охране недр, лесных, водных и рыбных ресурсов, а также животного мира. Президент подчеркнул, что “хозяйственные функции и ведомственный контроль в сфере лесного, водного и рыбного хозяйства останется в ведении министерства сельского хозяйства”.
Кроме того, президент считает, что министерство сельского хозяйства должно сконцентрироваться на “эффективной реализации агропродовольственной политики и повышении конкурентоспособности сельскохозяйственного производства в свете предстоящих задач по вступлению в ВТО”. В связи с этим глава государства предложил создать при министерстве сельского хозяйства комитет по ветеринарному и фитосанитарному надзору с территориальными подразделениями.