В 1948 году в финском Турку Исакова выиграла чемпионат мира в классическом многоборье, став первой в истории спортсменкой, завоевавшей для СССР чемпионский титул в зимних видах спорта. Два следующих года уроженка Вятки (так до 1934 года назывался город Киров) также становилась абсолютной чемпионкой мира. Кроме того, она шесть раз выигрывала чемпионат СССР в классическом многоборье.
В 1952 году Исакова завершила спортивную карьеру, перейдя на тренерскую работу в Федерацию конькобежного спорта СССР и общество “Динамо”. Достижения Марии Исаковой увековечены в Москве и Кирове. Так, в российской столице знаменитая конькобежка изображена на одном из барельефов станции метро “Динамо”, а в Кирове ее именем назван стадион.