Музей был открыт в день 60-летия Леннона 9 октября 2000 года. Его вдова Йоко Оно заключила десятилетний лицензионный контракт с музеем и передала в экспозицию около 130 предметов, включая любимую гитару Леннона, его знаменитые круглые очки, тексты песен и другие. Срок лицензии истек в четверг. Все вещи, находившиеся в экспозиции, вернутся к Оно.
В год открытия число посетителей составило 124 тысячи человек. Однако в последние годы музей посещало всего 30 тысяч человек в год.
В последний день работы музей вновь обрел былую популярность: перед входом выстроилась очередь — около ста почитателей таланта участника легендарной группы "Битлз", пожелавших на прощание вновь увидеть вещи Джона Леннона.