Изменения и уточнения, вносимые протоколом, имеют уточняющий характер и связаны со вступлением Чехии в Европейский союз и Казахстана в Таможенный союз. Протокол дополняет соглашение новой статьей, которой определяется, что никакие положения данного соглашения не могут быть истолкованы как препятствующие любой из сторон принимать меры, необходимые для защиты своих основных интересов безопасности.
Протокол был совершен в Астане 25 ноября 2010 года.